肿瘤学“圣经”《癌症生物学》第3版学习笔记系列之二
肿瘤学“圣经”《癌症生物学》第3版学习笔记系列之二Chapter 1: The Biology and Genetics of Cells and Organisms本章并非单纯复习基础生物学,而是系统梳理正常细胞赖以维持秩序的基本遗传规则。Weinberg 教授通过这一章确立了理解癌症的基准线:癌症是这些精妙规则在特定情境下的失效或被劫持。孟德尔遗传学的肿瘤学视角:显性与隐性: 这一区分奠定了理解两类关键基因的逻辑基础。在经典遗传学意义上,原癌基因 (Proto-oncogenes) 多表现为显性获得功能(一个拷贝突变即可驱动表型);而抑癌基因 (Tumor Suppressors) 多表现为隐性功能缺失(需双等位基因失活)。修正概念:单倍体不足 (Haploinsufficiency): 并非所有抑癌基因都遵循完全隐性模式。对于某些基因,仅丢失一个拷贝(导致蛋白水平减半)就足以损害细胞功能,无法维持正常的肿瘤抑制状态。遗传多态性 (Polymorphism): 人群中广泛存在的基因序列微小差异。大多数多态性不直接致病,但它们可作为风险修饰因子 (Risk Modifier),调节个体对致癌物的代谢能力或修复DNA损伤的效率,从而影响癌症易感性。体细胞突变 (Somatic Mutation): 癌症研究的核心在于区分生殖系突变(传给后代个体)与体细胞突变(仅传给细胞的后代)。癌症本质上是体细胞基因组发生改变的结果。突变的发生率: 基因组并非静止不变,突变以低概率但持续的方式发生。克隆演化 (Clonal Evolution): 这是一个微观的达尔文进化过程。一个细胞获得突变 -> 获得生存优势 -> 形成克隆 -> 再次突变。这一过程并非线性或必然,而是充满分支、淘汰与偶然性。非编码区的功能: 基因组中仅约 1.5% 编码蛋白质。曾被视为“垃圾DNA”的非编码区实际上富含调控元件(如增强子),这些区域的突变同样可能破坏基因表达调控,驱动癌症发生。非整倍体 (Aneuploidy): 正常细胞严格维持二倍体核型,而约90%的实体瘤显示出显著的非整倍体特征(染色体数目异常)。这不仅是基因组不稳定的结果,也被认为可能在某些情境下促进肿瘤演化(如增加原癌基因拷贝数)。染色体结构变异:易位 (Translocation): 可能导致原癌基因置于强启动子控制下(如伯基特淋巴瘤中的 MYC),或产生融合蛋白。基因扩增 (Gene Amplification): 在显微镜下表现为均质染色区 (HSR) 或双微体 (DMs)。这是癌细胞特有的机制,用于获得超量的生长促进蛋白。基因型决定表型,但这一过程受到多层级的精密调控,癌细胞常在这些节点进行干预。转录调控:多效性 (Pleiotropy): 转录因子 (TFs) 往往具有多效性,一个主调控因子可协调成千上万个下游基因的表达。癌细胞常通过劫持这些主调控因子(如 Myc)来重编程细胞状态。超级增强子 (Super-enhancers): 这是一个关键概念。这些密集的调控区域在癌细胞中常被重新配置,用于异常激活关键的生长与存活相关基因。RNA加工与剪接:可变剪接 (Alternative Splicing): 约93%的人类基因存在可变剪接。癌细胞通过改变剪接因子的活性,产生在功能上更有利于细胞存活或增殖的蛋白亚型(Isoforms)。翻译后修饰 (PTM): 如磷酸化、糖基化、泛素化等。这些修饰极大地扩展了蛋白质的功能多样性,也是信号转导的核心语言。microRNA (miRNA): 约22个核苷酸的小RNA。它们与靶mRNA结合,取决于互补程度,导致mRNA降解或翻译抑制。扮演致癌角色的miRNA被称为 OncoMiRs。lncRNA & circRNA: 长链非编码RNA和环状RNA。它们可作为分子脚手架组装蛋白复合物,或作为“海绵”吸附miRNA,在精细调控网络中发挥作用。表观遗传 (Epigenetics): 指DNA序列不变但基因表达状态可遗传的改变。组蛋白修饰: 决定染色质的可接近性。DNA甲基化: CpG双核苷酸的甲基化(常发生在启动子区域)通常与基因沉默相关。癌细胞常利用此机制关闭抑癌基因的表达。演化保守性: 无论是细胞周期控制还是信号转导通路,在从酵母、果蝇、线虫到人类的演化过程中均高度保守。直系同源物 (Orthologs): 不同物种间由共同祖先演化而来、功能对应的基因。这一特性确立了小鼠等模式生物在人类癌症研究中的核心地位。系统脆弱性: 本章展示了基因表达调控的极端复杂性(从增强子到剪接,再到表观遗传)。系统的复杂性本身即意味着脆弱性,每一个调控节点都可能成为癌细胞利用的漏洞。去特化趋势: 细胞分化依赖于组织特异性基因的表达。癌症的发展往往伴随着细胞“去分化”,即丢失特异性功能,退化到以管家基因 (Housekeeping genes) 维持生存并无限增殖的原始状态。技术与认知的协同: 这一章多次提及基因克隆、测序、CRISPR等技术。这提示我们,对癌症机制的理解深度,严格受限于观察工具的精度(如从核型分析到单细胞测序的跨越)。Somatic Mutation (体细胞突变):相较于生殖系突变,这是肿瘤发生的直接驱动力。Pleiotropy (多效性):解释了为何单一关键基因的突变能引起细胞表型的全面重塑。Haploinsufficiency (单倍体不足):修正了抑癌基因必须双拷贝失活的经典观点。Aneuploidy (非整倍体):实体瘤的普遍特征,既是结果也可能是演化的催化剂。