Linux学习笔记(一)|基础命令操作

最基础、最常用的命令，适合刚入门的同学反复查阅与练习。

一、目录与文件查看：ls

ls（list）用于显示当前目录下的文件和文件夹。

ls         # 显示当前目录下的内容 ls --help# 查看 ls 命令的帮助信息和参数说明 ls -a      # 显示所有文件，包括以 . 开头的隐藏文件 ls -l      # 以详细格式显示文件信息 ls -h      # 以人性化方式显示文件大小（K/M/G） ls -t      # 按修改时间排序（默认按文件名） ls -htl    # 参数组合使用（常用）`

ls -l 输出信息依次为：

文件类型与权限 ｜ 硬链接数 ｜ 所有者 ｜ 所属组 ｜ 文件大小 ｜ 修改时间 ｜ 文件名

二、工作目录相关操作

1. 创建与查看目录

mkdir new_dir   # 创建目录（make directory） pwd# 显示当前所在路径（print working directory）`

2. 切换目录

cd <路径>       # 切换工作目录（change directory）  cd ~            # 切换到当前用户的主目录 cd ./bio/       # 切换到当前目录下的bio文件夹 cd ../hhz/      # 切换到上一级目录下的hhz文件夹`

常见路径符号说明：

• ~：当前用户的主目录
• .：当前目录
• ..：上一级目录

三、文件的复制、移动与删除

cp    # 复制文件（copy）mv    # 移动文件或重命名文件（move） rm    # 删除文件（remove） rmdir # 删除空目录 rm -r # 递归删除目录及其所有内容`

强制删除（慎用）

rm -f     # 强制删除文件，不提示 rm -rf    # 强制递归删除目录（极其危险）`

注意：Linux 中删除操作不可恢复，请务必确认路径是否正确。

四、文件内容查看与简单处理

cat SNP_1.list      # 查看文件内容`

1. 文件合并

cat SNP_1.list SNP_2.list > SNP.list   # 合并文件（增加行数）

2. 分页查看文件

less SNP.list   # 可前后翻页、搜索 more SNP.list   # 简单分页，显示进度百分比`

3. 查看文件的前/后几行

head SNP.list         # 默认显示前 10 行 head -n 6 SNP.list    # 显示前 6 行  tail SNP.list         # 默认显示后 10 行 tail -n 6 SNP.list    # 显示后 6 行

4. 按列处理文件

cut -f 3 SNP_1.list   # 显示第 3 列（默认以制表符分隔）paste SNP_1.list SNP_2.list > SNP_3.list  # 按列合并文件（增加列数）

五、文件排序：sort

sort fruit.txt    # 按 ASCII 码升序排序sort -n -r number.txt # -n：按数字大小排序 # -r：降序排序sort -t : -k2n fruit.txt # -t ：指定分隔符 # -k2n：按第 2 列进行数字排序

六、去重统计：uniq

uniq 用于处理相邻重复行，通常需要先配合 sort 使用。

sort test.txt | uniqcut -f 1 SNP_test.list | sort | uniq -c

常用参数说明

七、文本处理利器：awk

awk 是 Linux 中非常强大的文本处理工具，以“行”为单位进行处理。

1. 基本语法

awk '{pattern + action}' 文件 awk 'pattern {action}' 文件

2. 常用内置变量

• $0：整行内容

• $1 ~ $N：第 1 到第 N 列

• FS：输入字段分隔符（默认空白）

• OFS：输出字段分隔符

• NR：当前行号（全局）

• FNR：当前文件的行号

• FILENAME：当前文件名

3. BEGIN 与 END 模块

• BEGIN：读取文件前执行（初始化）

• END：文件处理完成后执行（收尾操作）

4. 示例

# 显示第 6~12 行的第 3 列 awk 'NR>=6 && NR<=12 {print $3}' SNP_test.list`# 对第一列数值求和 awk 'BEGIN{sum=0} {sum+=$1} END{print sum}' SNP_1.list`